Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP2

IQSEC3, IQ motif and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQSEC3Q9UPP2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IQSEC3Q9UPP2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IQSEC3Q9UPP2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms