Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1RE1Q9UN81 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms