Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYNPO2Q9UMS6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNPO2Q9UMS6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms