Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RIMS3Q9UJD0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms