Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS7AQ9UBW8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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