Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC10Q9NYD6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms