Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 CACNA2D4-217ENST00000545595 1615 ntTSL 1 (best)16.01■□□□□ 0.152e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 ZFYVE21-210ENST00000556610 364 ntTSL 515.48■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 SLC12A4-207ENST00000571299 891 ntTSL 315.47■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.062e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 FAM193B-212ENST00000510163 2237 ntTSL 1 (best)15.28■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 ZFYVE21-206ENST00000554630 566 ntTSL 215.18■□□□□ 0.022e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 DDX11-224ENST00000543026 2066 ntTSL 215.11■□□□□ 0.012e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 CACNA2D4-205ENST00000536846 895 ntTSL 515.1■□□□□ 0.012e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -02e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 DDX11-230ENST00000545717 617 ntTSL 314.88□□□□□ -0.032e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 DDX11-217ENST00000540935 1210 ntTSL 214.81□□□□□ -0.042e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 STAU2-204ENST00000518767 1146 ntTSL 1 (best)14.73□□□□□ -0.052e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 RPS6KA1-205ENST00000403732 498 ntTSL 514.58□□□□□ -0.082e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 CACNA2D4-225ENST00000589502 680 ntTSL 314.46□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.122e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.132e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 UBA3-209ENST00000466763 622 ntTSL 214.08□□□□□ -0.162e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 UBA3-207ENST00000465108 804 ntTSL 214.08□□□□□ -0.162e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.162e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 HSPH1-206ENST00000602786 3488 ntTSL 1 (best)13.91□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 CACNA2D4-201ENST00000280663 5936 ntTSL 213.74□□□□□ -0.212e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 UBA3-210ENST00000485424 652 ntTSL 213.2□□□□□ -0.32e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.312e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 CACNA2D4-207ENST00000537923 556 ntTSL 412.98□□□□□ -0.332e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.332e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 BAG6-253ENST00000454165 544 ntTSL 312.81□□□□□ -0.362e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.362e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 SLC9A3R1-204ENST00000581356 519 ntTSL 312.74□□□□□ -0.372e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 OXNAD1-206ENST00000605932 1681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.422e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 CCDC85C-202ENST00000554877 543 ntTSL 412.34□□□□□ -0.432e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 DDX11-211ENST00000538345 498 ntTSL 512.22□□□□□ -0.452e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 UBA3-212ENST00000630585 390 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.482e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 CACNA2D4-218ENST00000585385 976 ntTSL 511.92□□□□□ -0.52e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 CACNA2D4-206ENST00000537784 2876 ntTSL 1 (best)11.89□□□□□ -0.512e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 DDX11-208ENST00000536265 3603 ntTSL 511.79□□□□□ -0.522e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 FAM193B-214ENST00000510479 2800 ntTSL 211.78□□□□□ -0.522e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 UBA3-211ENST00000493957 581 ntTSL 311.76□□□□□ -0.532e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 CACNA2D4-202ENST00000382722 5475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.532e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 RPS6KA1-219ENST00000531113 2089 ntTSL 211.67□□□□□ -0.542e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 RPS6KA1-220ENST00000531382 2359 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.542e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 URGCP-205ENST00000443736 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.562e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 CACNA2D4-219ENST00000585708 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.572e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 SPON1-AS1-201ENST00000534587 240 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.582e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 STAU2-228ENST00000524191 808 ntTSL 311.3□□□□□ -0.62e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 CCDC85C-205ENST00000556348 556 ntTSL 511.22□□□□□ -0.612e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 STAU2-214ENST00000521451 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.652e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 CCDC85C-207ENST00000557769 3793 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.662e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 RPS6KA1-202ENST00000374163 3202 ntTSL 210.73□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 STAU2-202ENST00000517542 1695 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.72e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 STAU2-203ENST00000518502 687 ntTSL 310.65□□□□□ -0.72e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.72e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 CCDC85C-203ENST00000554996 619 ntTSL 410.58□□□□□ -0.722e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 CCDC85C-201ENST00000380243 16393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.722e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 RPS6KA1-216ENST00000530003 3023 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.732e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 DDX11-204ENST00000435753 4182 ntTSL 510.5□□□□□ -0.732e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 DDX11-213ENST00000539049 3471 ntTSL 510.47□□□□□ -0.732e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 HSPH1-209ENST00000630972 3570 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.742e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 DDX11-201ENST00000228264 3717 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.752e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 STAU2-215ENST00000521727 3953 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.782e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 URGCP-202ENST00000402306 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.812e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 CACNA2D4-222ENST00000587995 3883 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.812e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 CACNA2D4-203ENST00000444595 4450 ntTSL 1 (best)9.99□□□□□ -0.812e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 CACNA2D4-221ENST00000586184 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.852e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 DDX11-229ENST00000545668 3751 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.852e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 DDX11-202ENST00000350437 3724 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.872e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 OXNAD1-207ENST00000606098 2288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.922e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 AGAP1-208ENST00000448025 757 ntTSL 59.22□□□□□ -0.932e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 CACNA2D4-223ENST00000588077 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.952e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 GSK3A-202ENST00000398249 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.972e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 AGAP1-206ENST00000418654 826 ntTSL 38.72□□□□□ -1.012e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 STAU2-226ENST00000524104 2173 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.122e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 HGD-209ENST00000492108 631 ntTSL 27.25□□□□□ -1.252e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 STAU2-205ENST00000518981 1746 ntTSL 26.02□□□□□ -1.452e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 STAU2-206ENST00000519818 590 ntTSL 45.78□□□□□ -1.482e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.522e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 STAU2-222ENST00000522962 1041 ntTSL 35.31□□□□□ -1.562e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.582e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 STAU2-227ENST00000524113 658 ntTSL 25.09□□□□□ -1.592e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 STAU2-218ENST00000522061 564 ntTSL 44.81□□□□□ -1.642e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.712e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 STAU2-216ENST00000521736 550 ntTSL 54.35□□□□□ -1.712e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 STAU2-213ENST00000521447 727 ntTSL 53.94□□□□□ -1.782e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 STAU2-223ENST00000523160 227 ntTSL 33.69□□□□□ -1.822e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 STAU2-209ENST00000520945 472 ntTSL 43.64□□□□□ -1.832e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 STAU2-217ENST00000521845 546 ntTSL 53.44□□□□□ -1.862e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 STAU2-211ENST00000521293 552 ntTSL 43.16□□□□□ -1.92e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.912e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.082e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 CANX-218ENST00000514032 1876 ntTSL 221.14■□□□□ 0.971e-8■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.191e-8■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.141e-8■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 CANX-209ENST00000504734 2232 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.41e-8■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 CCT3-214ENST00000490221 696 ntTSL 25.14□□□□□ -1.592e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.523e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.094e-6■■■■□ 25.8
RBM22Q9NW64 KIF2A-207ENST00000509663 759 ntTSL 319.68■□□□□ 0.744e-6■■■■□ 25.8
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