Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms