Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.736e-7■■■■■ 205.9
UTP3Q9NQZ2 MBD1-213ENST00000586118 1012 ntTSL 318.45■□□□□ 0.546e-7■■■■■ 205.9
UTP3Q9NQZ2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.416e-7■■■■■ 205.9
UTP3Q9NQZ2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.386e-7■■■■■ 205.9
UTP3Q9NQZ2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.356e-7■■■■■ 205.9
UTP3Q9NQZ2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.36e-7■■■■■ 205.9
UTP3Q9NQZ2 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.086e-7■■■■■ 205.9
UTP3Q9NQZ2 AC073529.1-201ENST00000608176 1549 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 205.9
UTP3Q9NQZ2 ACAP2-211ENST00000480906 1802 ntTSL 1 (best)17.47■□□□□ 0.399e-11■■■■■ 205.9
UTP3Q9NQZ2 BACH1-203ENST00000422809 850 ntTSL 59.47□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 205.8
UTP3Q9NQZ2 BACH1-208ENST00000468059 663 ntTSL 39.47□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 205.8
UTP3Q9NQZ2 RXRA-203ENST00000484822 5215 ntTSL 217.74■□□□□ 0.433e-7■■■■■ 205.8
UTP3Q9NQZ2 AGPAT3-209ENST00000448845 392 ntTSL 511.45□□□□□ -0.586e-10■■■■■ 205.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF274-206ENST00000595146 4852 ntTSL 1 (best)16.12■□□□□ 0.174e-7■■■■■ 205.6
UTP3Q9NQZ2 MIR663AHG-224ENST00000601119 750 ntTSL 514.34□□□□□ -0.117e-7■■■■■ 205.5
UTP3Q9NQZ2 MIR663AHG-226ENST00000601901 644 ntTSL 513.92□□□□□ -0.187e-7■■■■■ 205.5
UTP3Q9NQZ2 MIR663AHG-204ENST00000594130 628 ntTSL 513.38□□□□□ -0.277e-7■■■■■ 205.5
UTP3Q9NQZ2 MIR663AHG-234ENST00000609687 697 ntTSL 513.36□□□□□ -0.277e-7■■■■■ 205.5
UTP3Q9NQZ2 MIR663AHG-208ENST00000596058 665 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.527e-7■■■■■ 205.5
UTP3Q9NQZ2 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.147e-7■■■■■ 205.5
UTP3Q9NQZ2 MYO18A-204ENST00000528564 589 ntTSL 416■□□□□ 0.157e-7■■■■■ 205.4
UTP3Q9NQZ2 MYO18A-221ENST00000590242 637 ntTSL 213.19□□□□□ -0.37e-7■■■■■ 205.4
UTP3Q9NQZ2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.432e-6■■■■■ 205.4
UTP3Q9NQZ2 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 205.4
UTP3Q9NQZ2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.251e-6■■■■■ 205.4
UTP3Q9NQZ2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 205.4
UTP3Q9NQZ2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.495e-7■■■■■ 205.2
UTP3Q9NQZ2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.246e-7■■■■■ 205.2
UTP3Q9NQZ2 OGDH-203ENST00000439616 2962 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.326e-7■■■■■ 205.2
UTP3Q9NQZ2 OGDH-205ENST00000444676 3309 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.496e-7■■■■■ 205.2
UTP3Q9NQZ2 OGDH-201ENST00000222673 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.676e-7■■■■■ 205.2
UTP3Q9NQZ2 OGDH-207ENST00000449767 3479 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.696e-7■■■■■ 205.2
UTP3Q9NQZ2 OGDH-206ENST00000447398 3474 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.736e-7■■■■■ 205.2
UTP3Q9NQZ2 OGDH-210ENST00000631326 4116 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.96e-7■■■■■ 205.2
UTP3Q9NQZ2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.933e-8■■■■■ 205.1
UTP3Q9NQZ2 AZIN1-202ENST00000347770 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.833e-8■■■■■ 205.1
UTP3Q9NQZ2 EGF-201ENST00000265171 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.511e-10■■■■■ 205.1
UTP3Q9NQZ2 EGF-206ENST00000509793 4489 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.761e-10■■■■■ 205.1
UTP3Q9NQZ2 EGF-204ENST00000503392 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.861e-10■■■■■ 205.1
UTP3Q9NQZ2 IDUA-202ENST00000502829 558 ntTSL 229.67■■■□□ 2.343e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 IL4R-206ENST00000562142 518 ntTSL 326.42■■□□□ 1.823e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 IL4R-216ENST00000566117 529 ntTSL 524.71■■□□□ 1.553e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.298e-8■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 HMGXB4-203ENST00000420166 1257 ntTSL 222.1■■□□□ 1.133e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 GAS8-208ENST00000564789 810 ntTSL 221.01■□□□□ 0.953e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 GAS8-215ENST00000568284 436 ntTSL 221.01■□□□□ 0.953e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.843e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 TSC22D3-209ENST00000502650 567 ntTSL 420.1■□□□□ 0.813e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 TADA2A-203ENST00000614112 561 ntTSL 419.91■□□□□ 0.783e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.744e-8■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 CRELD2-208ENST00000482956 855 ntTSL 1 (best)18.9■□□□□ 0.625e-8■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 TADA2A-204ENST00000614122 1003 ntTSL 518.83■□□□□ 0.63e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 AL669831.3-204ENST00000440196 1022 ntTSL 518.55■□□□□ 0.563e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 TADA2A-213ENST00000620628 2211 ntTSL 518.49■□□□□ 0.553e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 ABCC10-203ENST00000372515 933 ntTSL 518.44■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 AL669831.3-205ENST00000641296 1127 nt18.38■□□□□ 0.533e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.493e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.484e-8■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 DOLPP1-204ENST00000412363 911 ntTSL 517.79■□□□□ 0.443e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 IL4R-217ENST00000566318 688 ntTSL 317.56■□□□□ 0.43e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 GNPAT-202ENST00000416000 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.55■□□□□ 0.43e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 PPFIA4-205ENST00000486360 4547 ntTSL 217.48■□□□□ 0.393e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.323e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.293e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.234e-8■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 IL4R-204ENST00000561742 379 ntTSL 316.35■□□□□ 0.213e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 IL4R-211ENST00000563926 594 ntTSL 416.35■□□□□ 0.213e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 STRN4-210ENST00000594847 814 ntTSL 316.19■□□□□ 0.184e-9■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.154e-8■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.114e-8■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.084e-8■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 ZFP64-212ENST00000477786 909 ntTSL 515.5■□□□□ 0.074e-8■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 HMGXB4-204ENST00000455359 1325 ntTSL 1 (best)15.25■□□□□ 0.033e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.013e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 TSC22D3-215ENST00000510887 581 ntTSL 414.8□□□□□ -0.043e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.054e-8■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 TRPM4-214ENST00000601347 642 ntTSL 414.72□□□□□ -0.053e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 IL4R-208ENST00000563002 541 ntTSL 514.71□□□□□ -0.053e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 SLC25A24-203ENST00000565488 4271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.095e-8■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 IL4R-218ENST00000568746 2900 ntTSL 214.42□□□□□ -0.13e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 GAK-220ENST00000513935 573 ntTSL 214.35□□□□□ -0.111e-19■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 SETDB2-203ENST00000354234 6139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.163e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 CNOT1-217ENST00000569263 304 ntTSL 214.02□□□□□ -0.173e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 SETDB2-204ENST00000481439 574 ntTSL 1 (best)13.9□□□□□ -0.183e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.254e-8■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 CLDN12-213ENST00000496677 1098 ntTSL 1 (best)13.12□□□□□ -0.313e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 PNMA8A-201ENST00000313683 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.323e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 COMMD10-204ENST00000507356 870 ntTSL 313□□□□□ -0.334e-8■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.334e-8■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 NFIX-204ENST00000585382 1083 ntTSL 512.97□□□□□ -0.332e-12■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 CAPN2-203ENST00000434648 577 ntTSL 512.88□□□□□ -0.351e-10■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 ZFP64-202ENST00000346617 2876 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.424e-8■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 TSC22D3-217ENST00000514897 802 ntTSL 412.35□□□□□ -0.433e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 IL4R-205ENST00000561946 611 ntTSL 312.3□□□□□ -0.443e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 SLC25A24-201ENST00000264128 3320 ntTSL 511.99□□□□□ -0.495e-8■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 TSC22D3-207ENST00000480691 546 ntTSL 411.86□□□□□ -0.513e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 IL4R-203ENST00000543915 3539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.513e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 ZFP64-204ENST00000371515 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.524e-8■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 ENTPD7-201ENST00000370489 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.523e-16■■■■■ 205
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