Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIT2Q9NQR4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms