Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NRIP3Q9NQ35 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms