Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms