Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms