Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms