Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms