Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPJQ9HC77 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms