Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms