Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms