Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LINC00597Q9H2U6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms