Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms