Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms