Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms