Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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