Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms