Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms