Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECSITQ9BQ95 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms