Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRBNQ96SW2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CRBNQ96SW2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms