Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms