Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms