Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms