Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms