Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SAMD8Q96LT4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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SAMD8Q96LT4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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SAMD8Q96LT4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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SAMD8Q96LT4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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SAMD8Q96LT4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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SAMD8Q96LT4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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SAMD8Q96LT4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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SAMD8Q96LT4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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SAMD8Q96LT4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
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