Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms