Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDC3Q96F86 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms