Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC97Q96F63 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC97Q96F63 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC97Q96F63 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC97Q96F63 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC97Q96F63 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC97Q96F63 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC97Q96F63 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC97Q96F63 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC97Q96F63 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC97Q96F63 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC97Q96F63 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC97Q96F63 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC97Q96F63 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms