Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAF2Q96CS3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms