Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms