Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms