Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRF1Q92994 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms