Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRAT1Q92837 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms