Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms