Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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