Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNBD1Q8NA66 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms