Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z2

CCDC71L, Coiled-coil domain-containing protein 71L, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71LQ8N9Z2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC71LQ8N9Z2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms