Protein–RNA interactions for Protein: Q8N841

TTLL6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL6Q8N841 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTLL6Q8N841 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms