Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU89

CERS3, Ceramide synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS3Q8IU89 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CERS3Q8IU89 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms