Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE3BQ7Z3V4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms