Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms