Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms