Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LETMD1Q6P1Q0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms